Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX1P40424 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX1P40424 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX1P40424 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX1P40424 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms