Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 NTF2YER009W 378 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 BNA6YFR047C 888 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 VMA10YHR039C-A 345 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 HOR7YMR251W-A 180 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YOR318CYOR318C 306 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YEH2YLR020C 1617 nt5.29□□□□□ -1.56
SLX8P40072 HXT14YNL318C 1623 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 API2YDR525W 330 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 COX4YGL187C 468 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YPT32YGL210W 669 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 ERV1YGR029W 570 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YGR035CYGR035C 351 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YGR073CYGR073C 372 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 JLP2YMR132C 627 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 ERG2YMR202W 669 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YPL062WYPL062W 405 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 RPN3YER021W 1572 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 EBS1YDR206W 2655 nt5.28□□□□□ -1.56
SLX8P40072 GSY2YLR258W 2118 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 JIP5YPR169W 1479 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 CYM1YDR430C 2970 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YCR090CYCR090C 549 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 SYO1YDL063C 1863 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 GCN4YEL009C 846 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 RPA12YJR063W 378 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 ADI1YMR009W 540 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 CMD1YBR109C 444 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YJR098CYJR098C 1971 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YHR182WYHR182W 2358 nt5.27□□□□□ -1.57
SLX8P40072 GCS1YDL226C 1059 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YEL057CYEL057C 702 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YEL077CYEL077C 3834 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 OTU1YFL044C 906 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YGR025WYGR025W 303 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 PDX1YGR193C 1233 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 GAT4YIR013C 366 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 VPS63YLR261C 327 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YPT53YNL093W 663 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 NDC80YIL144W 2076 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 DAL81YIR023W 2913 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 SEC2YNL272C 2280 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 BIT2YBR270C 1638 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 MDM36YPR083W 1740 nt5.26□□□□□ -1.57
SLX8P40072 PRM1YNL279W 1986 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 RPS29BYDL061C 171 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 NHP2YDL208W 471 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 RPS18AYDR450W 441 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 INN1YNL152W 1230 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 OST2YOR103C 393 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 NSL1YPL233W 651 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 BCK2YER167W 2556 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 SSF2YDR312W 1362 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 PSP1YDR505C 2526 nt5.25□□□□□ -1.57
SLX8P40072 GAL10YBR019C 2100 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 DAK1YML070W 1755 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 DAL5YJR152W 1632 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 IZH3YLR023C 1632 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 RIM21YNL294C 1602 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 PEX6YNL329C 3093 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 PER1YCR044C 1074 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YDR413CYDR413C 576 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 CGR1YGL029W 363 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 MTM1YGR257C 1101 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 CRG1YHR209W 876 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 DFG10YIL049W 762 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YAR029WYAR029W 225 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 AAR2YBL074C 1068 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YCL012CYCL012C 405 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 GPI1YGR216C 1830 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 LST4YKL176C 2487 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 EXO70YJL085W 1872 nt5.24□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 SWC4YGR002C 1431 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 AYT1YLL063C 1425 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YFL068WYFL068W 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 COX8YLR395C 237 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 RPL21BYPL079W 483 nt5.23□□□□□ -1.57
SLX8P40072 YPL107WYPL107W 747 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.8 ms