Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms