Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS4P35443 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS4P35443 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS4P35443 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
THBS4P35443 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS4P35443 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THBS4P35443 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms