Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCGF2P35227 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCGF2P35227 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms