Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP6P35125 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP6P35125 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP6P35125 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP6P35125 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP6P35125 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP6P35125 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
USP6P35125 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP6P35125 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP6P35125 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP6P35125 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP6P35125 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms