Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.34□□□□□ -1.87
YBL055CP34220 YJL114WYJL114W 681 nt3.34□□□□□ -1.87
YBL055CP34220 YKL115CYKL115C 393 nt3.34□□□□□ -1.87
YBL055CP34220 ATG10YLL042C 504 nt3.34□□□□□ -1.87
YBL055CP34220 AGE1YDR524C 1449 nt3.34□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 NOP4YPL043W 2058 nt3.34□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 DUN1YDL101C 1542 nt3.34□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YMR018WYMR018W 1545 nt3.34□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 APC5YOR249C 2058 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RIM1YCR028C-A 408 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 HTA1YDR225W 399 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 VFA1YER128W 612 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YGL082WYGL082W 1146 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YGR160WYGR160W 612 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YJL147CYJL147C 1149 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 GTT2YLL060C 702 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YNL013CYNL013C 378 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YCL002CYCL002C 792 nt3.33□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ARP5YNL059C 2268 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YHR080CYHR080C 4038 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YDR431WYDR431W 312 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 VAB2YEL005C 849 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 BRR6YGL247W 594 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YGR126WYGR126W 693 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 GOS1YHL031C 672 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YHR180WYHR180W 492 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 AGE2YIL044C 897 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YJR020WYJR020W 333 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YLR400WYLR400W 474 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ERG2YMR202W 669 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ATP11YNL315C 957 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 TRM82YDR165W 1335 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 HRD1YOL013C 1656 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 VPS33YLR396C 2076 nt3.32□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YGR237CYGR237C 2358 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 TPO5YKL174C 1857 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 VPS17YOR132W 1656 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 AEP1YMR064W 1557 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 GRX2YDR513W 432 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 LOC1YFR001W 615 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 DLS1YJL065C 504 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RNH203YLR154C 333 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 REC102YLR329W 795 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 OCA2YNL056W 594 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 TSR4YOL022C 1227 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 HHF1YBR009C 312 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YBR053CYBR053C 1077 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 FLO5YHR211W 3228 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 SEA4YBL104C 3117 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YSP2YDR326C 4317 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 IRC3YDR332W 2070 nt3.31□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RPN2YIL075C 2838 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 NRG1YDR043C 696 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 SLU7YDR088C 1149 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YDR509WYDR509W 348 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YFH7YFR007W 1062 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 CDC26YFR036W 375 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RPL1BYGL135W 654 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 TPK3YKL166C 1197 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RPL1AYPL220W 654 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 CHS3YBR023C 3498 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 BEM4YPL161C 1902 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 DRS2YAL026C 4068 nt3.3□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 POL2YNL262W 6669 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 LIF1YGL090W 1266 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 LST7YGR057C 729 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 PRP38YGR075C 729 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RNR2YJL026W 1200 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ATG27YJL178C 816 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RPA12YJR063W 378 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 IME1YJR094C 1083 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 MRP8YKL142W 660 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 PIR1YKL164C 1026 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ATG38YLR211C 681 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 SRL1YOR247W 633 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 HUT1YPL244C 1020 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 CHO2YGR157W 2610 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 FAS1YKL182W 6156 nt3.29□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 KRE2YDR483W 1329 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 NSE4YDL105W 1209 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 ARF1YDL192W 546 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YFL015CYFL015C 495 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 RPL13BYMR142C 600 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 VAM10YOR068C 345 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 YOR387CYOR387C 621 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 CHS2YBR038W 2892 nt3.28□□□□□ -1.88
YBL055CP34220 CDC40YDR364C 1368 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 YPS6YIR039C 1614 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 ERG9YHR190W 1335 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 RAV2YDR202C 1056 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 PEX10YDR265W 1014 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 KEI1YDR367W 666 nt3.27□□□□□ -1.89
YBL055CP34220 RSM18YER050C 417 nt3.27□□□□□ -1.89
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