Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC12P31275 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms