Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND3P30281 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND3P30281 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND3P30281 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND3P30281 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND3P30281 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND3P30281 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms