Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD1P28340 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLD1P28340 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLD1P28340 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD1P28340 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD1P28340 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD1P28340 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD1P28340 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD1P28340 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms