Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPREP23469 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPREP23469 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPREP23469 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPREP23469 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPREP23469 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPREP23469 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPREP23469 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPREP23469 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPREP23469 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms