Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms