Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKACBP22694 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms