Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms