Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCLP19338 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCLP19338 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCLP19338 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCLP19338 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLP19338 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLP19338 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLP19338 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLP19338 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLP19338 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLP19338 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLP19338 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms