Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD58P19256 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD58P19256 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD58P19256 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD58P19256 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD58P19256 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD58P19256 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD58P19256 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms