Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLT1P17948 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLT1P17948 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLT1P17948 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLT1P17948 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FLT1P17948 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FLT1P17948 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FLT1P17948 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FLT1P17948 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLT1P17948 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLT1P17948 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLT1P17948 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLT1P17948 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLT1P17948 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLT1P17948 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms