Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms