Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPCAMP16422 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms