Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRA1P14867 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA1P14867 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms