Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF35P13682 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms