Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN1P12814 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms