Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL11A1P12107 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms