Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRFP10586 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms