Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP2CP0DJJ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms