Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms