Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 TFC1YBR123C 1950 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 IMH1YLR309C 2736 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 IRC10YOL015W 1761 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 YOR238WYOR238W 912 nt2.36□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 DNF3YMR162C 4971 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 CTF13YMR094W 1437 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 CDC55YGL190C 1581 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 OKP1YGR179C 1221 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 TRZ1YKR079C 2517 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 PHO12YHR215W 1404 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 PHO11YAR071W 1404 nt2.35□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 PFD1YJL179W 330 nt2.34□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 ATG29YPL166W 642 nt2.34□□□□□ -2.03
YRF1-5P0CX21 SMC1YFL008W 3678 nt2.34□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 ADY4YLR227C 1482 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 CPR5YDR304C 678 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 AIM23YJL131C 1071 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YOR292CYOR292C 930 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 NAN1YPL126W 2691 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 MDM10YAL010C 1482 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 RSM25YIL093C 795 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 FRE2YKL220C 2136 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 ISF1YMR081C 1017 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SSU72YNL222W 621 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 snR3snR3 194 nt2.33□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SAC3YDR159W 3906 nt2.32□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SET1YHR119W 3243 nt2.32□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt2.32□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YDL118WYDL118W 381 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 MAC1YMR021C 1254 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 RRP7YCL031C 894 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SAD1YFR005C 1347 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 PHO13YDL236W 939 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 CTK2YJL006C 972 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YPR203WYPR203W 309 nt2.31□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 ISW1YBR245C 3390 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 HMO1YDR174W 741 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 FAR11YNL127W 2862 nt2.3□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 CBS2YDR197W 1170 nt2.29□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YJL015CYJL015C 285 nt2.29□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 TRX1YLR043C 312 nt2.29□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 ENV10YLR065C 546 nt2.29□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YFR045WYFR045W 930 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 MRE11YMR224C 2079 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 GCD7YLR291C 1146 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YML053CYML053C 639 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 SPO20YMR017W 1194 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 YOR146WYOR146W 306 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 TOP1YOL006C 2310 nt2.28□□□□□ -2.04
YRF1-5P0CX21 OST1YJL002C 1431 nt2.28□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 FIG4YNL325C 2640 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 ATG32YIL146C 1590 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 CLU1YMR012W 3834 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 YVH1YIR026C 1095 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 DAD3YBR233W-A 285 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 VPS35YJL154C 2835 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 EPO1YMR124W 2832 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 AGE1YDR524C 1449 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 MAK10YEL053C 2202 nt2.27□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 FES1YBR101C 873 nt2.26□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 UTP21YLR409C 2820 nt2.26□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 ERV29YGR284C 933 nt2.26□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 RPS1AYLR441C 768 nt2.26□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 TPS2YDR074W 2691 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 PRP6YBR055C 2700 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 YAE1YJR067C 426 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 DAD2YKR083C 402 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 PCD1YLR151C 1023 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 OST6YML019W 999 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 ATG34YOL083W 1239 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 YRB30YGL164C 1323 nt2.25□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 YPR117WYPR117W 7470 nt2.24□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 IDH2YOR136W 1110 nt2.24□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 HUA2YOR284W 732 nt2.24□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 INA17YPL099C 549 nt2.24□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 CNM67YNL225C 1746 nt2.24□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 NOP6YDL213C 678 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 YPR077CYPR077C 372 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 ORC4YPR162C 1590 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 CLB4YLR210W 1383 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 GEA2YEL022W 4380 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 DAS2YDR020C 699 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 AIM39YOL053W 1188 nt2.23□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 UTP13YLR222C 2454 nt2.22□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 APM3YBR288C 1452 nt2.22□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 MEC1YBR136W 7107 nt2.22□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 SYH1YPL105C 2550 nt2.22□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 IRA1YBR140C 9279 nt2.21□□□□□ -2.05
YRF1-5P0CX21 ARP10YDR106W 855 nt2.21□□□□□ -2.06
YRF1-5P0CX21 YML003WYML003W 873 nt2.21□□□□□ -2.06
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