Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms