Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms