Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTAP09496 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTAP09496 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTAP09496 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLTAP09496 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTAP09496 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms