Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPM2P07951 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPM2P07951 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPM2P07951 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms