Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFMP07197 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFMP07197 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFMP07197 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFMP07197 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFMP07197 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFMP07197 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFMP07197 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFMP07197 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFMP07197 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms