Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APODP05090 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APODP05090 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APODP05090 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APODP05090 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APODP05090 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APODP05090 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APODP05090 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APODP05090 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APODP05090 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APODP05090 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms