Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRM2P04554 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRM2P04554 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRM2P04554 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRM2P04554 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRM2P04554 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRM2P04554 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRM2P04554 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms