Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms