Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NSD2O96028 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD2O96028 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD2O96028 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD2O96028 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD2O96028 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD2O96028 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD2O96028 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD2O96028 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD2O96028 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD2O96028 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD2O96028 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD2O96028 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms