Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR1AO95602 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms