Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB6O95452 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB6O95452 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB6O95452 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB6O95452 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB6O95452 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB6O95452 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB6O95452 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB6O95452 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms