Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UFL1O94874 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UFL1O94874 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UFL1O94874 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UFL1O94874 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UFL1O94874 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UFL1O94874 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UFL1O94874 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UFL1O94874 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UFL1O94874 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UFL1O94874 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms