Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASSF9O75901 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF9O75901 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF9O75901 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF9O75901 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASSF9O75901 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RASSF9O75901 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASSF9O75901 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RASSF9O75901 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF9O75901 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF9O75901 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF9O75901 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASSF9O75901 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms