Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN11O75508 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms