Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMPCBO75439 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMPCBO75439 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMPCBO75439 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PMPCBO75439 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PMPCBO75439 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMPCBO75439 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMPCBO75439 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMPCBO75439 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMPCBO75439 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PMPCBO75439 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMPCBO75439 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms