Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CILPO75339 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CILPO75339 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CILPO75339 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CILPO75339 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CILPO75339 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CILPO75339 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CILPO75339 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CILPO75339 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CILPO75339 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CILPO75339 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CILPO75339 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CILPO75339 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CILPO75339 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CILPO75339 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CILPO75339 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CILPO75339 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms