Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP2O75323 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms