Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms