Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2DO15399 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN2DO15399 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms