Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBDO15205 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBDO15205 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBDO15205 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBDO15205 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBDO15205 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBDO15205 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms