Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNMO15061 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNMO15061 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNMO15061 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNMO15061 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNMO15061 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYNMO15061 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms