Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A2O14975 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A2O14975 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms