Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF6O14896 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF6O14896 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF6O14896 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF6O14896 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms